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2013年12月5日內政部公布，南投縣清境地區高達64%地質屬於中高災害風險區，總計134家民宿中僅4家「完全合法」。
2013年5月時，因為墾丁渡假村違規案，引發軒然大波。內政部便已調查，清境也是民宿違建嚴重，是另一顆未爆彈，只是當時並未引起廣大關注。直到10月導演齊柏林拍攝的紀錄片《看見台灣》上映，清境農場的非法民宿才成為矚目焦點。
清境超過6成範圍都有大規模崩塌的可能，若濫墾、濫建再不改善，許多人都擔憂若發生地震或豪大雨，後果不堪設想。但違法民宿問題在政府、環保團體、業者的多方意見下，難有共識。時任內政部長的李鴻源（見圖，本報資料照片）就直言，違法民宿拆遷「不是法律問題，而是政治問題」。
然而，江宜樺內閣閣員民調滿意度最高、又是水利工程專長的李鴻源，還來不及解決違法民宿以及山坡地等問題，國土規畫使命未竟，2014年2月卻先因為新戶役政資訊系統出槌下台。
5月南投縣政府提出「新訂清境風景特定區計畫」解決方案，將現有民宿分布區改畫為風景區，按照原計畫書其中約40家民宿恐「就地合法」，但新公布的地質敏感地帶範圍遠大於舊有調查，環保署環評委員會依程序有問題退回縣府。12月3日進行第二次環評會議，依舊各自表述。
早在2003年清境過度開發的問題就已浮出檯面，直到2013年大家才知道民宿不止濫建還建在地質敏感帶。馬政府主動查出問題，反而折損一名防災大將，如今，要馬政府期間作更耗時的國土完整性調查與規畫，恐成不可能的任務。目前南投縣政府只能先對無照的民宿進行拆除。
清境歷史遺留的難題，懸而未決，觀光客的居住安全，仍和處在地質敏感區的民宿一起掛半山腰上，岌岌可危。
但違法民宿問題在政府、環保團體、業者的多方意見下，難有共識。時任內政部長的李鴻源（見圖，本報資料照片）就直言，違法民宿拆遷「不是法律問題，而是政治問題」。
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